Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms