Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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