Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim24Q64127 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms