Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a5Q63ZW6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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