Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SnrpcQ62241 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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SnrpcQ62241 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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SnrpcQ62241 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SnrpcQ62241 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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