Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpaQ62189 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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