Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctr9Q62018 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctr9Q62018 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms