Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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BcanQ61361 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BcanQ61361 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BcanQ61361 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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