Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.8 ms