Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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