Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Klf3Q60980 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms