Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms