Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms