Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trim38Q5SZ99 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trim38Q5SZ99 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim38Q5SZ99 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim38Q5SZ99 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim38Q5SZ99 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim38Q5SZ99 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim38Q5SZ99 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim38Q5SZ99 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim38Q5SZ99 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trim38Q5SZ99 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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