Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tsr1Q5SWD9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tsr1Q5SWD9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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