Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp18Q5SSI6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms