Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms