Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms