Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmprss11eQ5S248 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmprss11eQ5S248 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmprss11eQ5S248 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmprss11eQ5S248 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmprss11eQ5S248 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmprss11eQ5S248 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmprss11eQ5S248 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmprss11eQ5S248 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmprss11eQ5S248 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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