Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim58Q5NCC9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms