Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q5EBG8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms