Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam208bQ5DTT3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms