Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnl1Q52KE7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnl1Q52KE7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms