Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shank3Q4ACU6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms