Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms