Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc27Q3V036 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms