Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms