Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.6 ms