Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms