Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms