Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms