Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc33Q3ULW6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc33Q3ULW6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc33Q3ULW6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc33Q3ULW6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms