Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms