Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atxn7l3bQ3UD01 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms