Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gtpbp6Q3U6U5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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