Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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