Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms