Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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