Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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