Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms