Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms