Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms