Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms