Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms