Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cpne9Q1RLL3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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