Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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