Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rpusd3Q14AI6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rpusd3Q14AI6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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