Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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VgfQ0VGU4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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VgfQ0VGU4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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VgfQ0VGU4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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VgfQ0VGU4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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VgfQ0VGU4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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VgfQ0VGU4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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VgfQ0VGU4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms