Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms