Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms